種苗の品質は製品の品質に大きく影響します。成長率や罹病率が優れたよい種苗を信頼できる種苗生産業者から導入しています。種苗の遺伝的性質や稚魚期の環境は体色や成長、耐病性などに大きく影響します。10cm前後で導入した稚魚は通常１年半から２年で約1.5キロになり出荷されます。

マリンジャパンが使用している養殖魚の飼料は全て国内メーカーが製造した信頼性の高い飼料です。高品質な飼料を使用することで魚の良好な成長を促進し身質と味の優れた養殖魚を生産することが出来ます。また、持続可能な養殖事業を目指した低魚粉飼料、植物蛋白飼料への取組みも行っています。

マリンジャパンの養殖魚は抗生物質の使用を最小にするためワクチンを一尾一尾に接種しています。大変な労力とコストがかかりますが安心安全な魚を作るためには欠かすことが出来ません。また、水質や生簀の状態、飼料や栄養剤にも工夫をすることで健康な魚を作ることを目指しています。